Professor Birgit Schiøtt er fra 1. februar 2017 blevet ansat som institutleder på Institut for Kemi, Aarhus Universitet, hvor hun har været konstitueret institutleder siden december 2014.
Udover ledelsesopgaverne deltager Birgit Schiøtt stadig aktivt i forskningen. Hun er til daglig leder af ”Biomodelleringsgruppen” på Institut for Kemi, der beskæftiger sig med proteiners og andre biomolekylers indbyrdes vekselvirkninger, specielt med fokus på hjernens kemi, men hun arbejder også med andre emner som eksempelvis peptider involveret i Type 2 Diabetes og forskellige teknologisk vigtige peptider og proteiner. Hun er desuden tilknyttet iNANO og har mange samarbejdsprojekter med medicinal- og bioteknologiske virksomheder og akademiske forskningsgrupper i både Danmark og udlandet. Det inkluderer f.eks. Oxford University, University of California, San Diego og University of Illinois, samt for tiden både Novozymes og Lundbeck i Danmark og amerikanske Aptinyx.