• Facebook
  • LinkedIn
  • KONTAKT
  • ANNONCERING
  • OM KEMIFOKUS
  • PARTNERLOGIN

KemiFOKUS

Fokus på kemi

  • Analytisk kemi
  • Arbejdsmiljø/Indeklima
  • Biokemi
  • Biologi
  • Bioteknologi
  • Branchenyt
  • Energi
  • Fødevarekemi
  • Historisk kemi
  • Kemiteknik
  • Kemometri
  • Klikkemi
  • Klima og miljø
  • Lovgivning og patenter
  • Medicinalkemi
  • Nanoteknologi
  • Organisk kemi
  • Artikler fra Dansk Kemi

BioteknologiKlima og miljø01. 05. 2003 | Katrine Meyn

IA-LC-MS giver nye dimensioner i analytisk kemi

BioteknologiKlima og miljø01. 05. 2003 By Katrine Meyn

Immunassays, dvs. analytiske metoder der baserer sig på antigen-antistofreaktioner, omfatter mere end kvantitative fastfase-assays (ELISA). Her omtales metoder, der ved at kombinere immunkemisk selektivitet med massespektrometri løser problemer, som ikke kan løses med ELISA. 

Læs originalartiklen her

Artiklen har været bragt i Dansk Kemi nr. 5, 2003 og kan læses uden illustrationer, strukturer og ligninger herunder. Se relaterede artikler nederst på siden.

Af Jette W. Sen1, Morten Z. Hansen, Niels H. H. Heegaard, Autoimmunafdelingen, Statens Serum Institut
1 nuværende adresse: Klinisk Biokemisk Afdeling, Rigshospitalet

Antistoffer er proteiner, der specifikt genkender og binder andre molekyler (antigener) i non-kovalente interaktioner. Polyklonale antistoffer induceres ved immuniseringer (vaccinationer), mens monoklonale antistoffer produceres af udødeliggjorte, klonede antistofproducerende enkeltceller fra immuniserede dyr eller individer. Et monoklonalt antistof binder normalt et bestemt område (en epitop) på antigenet, mens et polyklonalt antistof er en samling af forskellige antistofmolekyler, der binder flere forskellige epitoper med flere forskellige bindingsstyrker på antigenet. Antigener, der er delvist forandrede, kan således fortsat binde polyklonale antistoffer, hvis sådanne antigener har genkendelige epitoper (figur 1).
Metoder, der udnytter antigen-antistofreaktioner, er vidt udbredte i analytisk kemi, specielt i form af fastfase enzym-immunosorbent assays (ELISA).
I disse assays udnyttes antistoffer til at måle specifikke analytter i komplicerede biologiske matricer som f.eks. humant serum. Mange forskellige udformninger af metoderne er mulige, men de baserer sig alle på reaktioner mellem antigener og antistoffer (immunaffinitetsreaktioner) og på immobilisering af et af reagenserne på en fast fase [1]. Fastfase-immunassays er automatisérbare, tillader parallel processering af mange prøver, giver et kvantitativt resultat og er relativt lette at udvikle – hvis man har passende antistoffer – og derfor har de stor udbredelse inden for klinisk biokemi.
Problemet med fastfase-immunassays er, at signalet er et udtryk for den samlede reaktion af et antistof med molekyler, der ud over en fællesmængde af epitoper meget vel kan være heterogene. Netop sammensætningen af de reagerende antigener kan ikke vurderes, da den eneste separation, der indgår i fastfase-immunassays, er adskillelsen af kompleksbundne fra frie reagenser. Det kan for proteiner og peptider betyde, at eksempelvis posttranslationelle modifikationer (fosforyleringer, glycosyleringer, deletioner) eller punktmutationer i aminosyresekvensen forbliver uerkendte. Da sådanne molekylære varianter er interessante ud fra et medicinsk, biologisk og diagnostisk synspunkt, er det ønskværdigt at kunne måle dem specifikt. Fastfase-immunassays kan kun benyttes, hvis der udvikles specifikke (oftest monoklonale) antistoffer for de molekylære varianter, dvs. hvis man i forvejen har en idé om, hvad man skal lede efter.
Ved at kombinere moderne højopløsnings-separationsmetoder med immunaffinitetsteknikker i en todimensionel analysestrategi kan man opnå en meget præcis diskrimination af molekylære varianter i en gruppe af molekyler, der alle reagerer med et antistof.
Et skematisk eksempel er vist i figur 1, hvor et anti-peptidantistof med specificitet for den markerede (grønne) epitop i et peptid binder alle de fem peptider på trods af, at der er forskelle i N- og C-terminaler. Uafhængigt af det faktiske mængdeforhold mellem varianterne vil antistofbindingen resultere i ét signal i en ELISA, nemlig summen af reaktiviteten med alle antistofbindende molekyler. Peptiderne kan til gengæld differentieres med metoder, der separerer på grundlag af masseforskelle (figur 1). Massespektrometri (MS) har i de senere år vist sig at være vigtig for biologisk forskning. Her adskilles molekyler i gasfasen efter deres masser (eller mere præcist efter deres masse/ladningsforhold (m/z)). I forhold til mange andre analytiske metoder (f.eks. gel-elektroforese, størrelseschromatografi og ultracentrifugering) der kan benyttes til at størrelsesadskille molekyler, men ikke magter f.eks. at adskille de fem peptidformer illustreret i figur 1, er MS overlegen mht. præcisionen i massebestemmelsen. MS-målinger gør det muligt, f.eks. i et proteinmolekyle med en masse på omkring 10-15.000, at afgøre, om en enkelt aminosyre er oxideret eller ej, dvs. at adskille molekylmasseforskelle på 16. Ofte er opløsningsevnen endnu højere.
I klinisk biokemiske undersøgelser er man ofte interesseret i at undersøge netop varianter i peptider og proteiner hos patienter i diagnostisk øjemed, og her er den todimensionelle immunaffinitets-MS strategi af stor værdi.

Det todimensionelle immunaffinitetssystem
Det todimensionelle immunaffinitets-MS-system (figur 2 og 3) udnytter flere væskechromatografiske matricers egenskaber til at isolere specifikke analytter fra biologiske væsker såsom serum. Først isoleres analytten efter forbehandling af prøven ved passage igennem en såkaldt preclear-søjle (affinitetsmatrice koblet med irrelevant antistof) vha. immunaffinitetschromatografi. Derefter afsaltes prøven på en omvendt fase (reversed phase)-søjle, og til sidst karakteriseres det opfangne materiale ved brug af et massespektrometer forbundet (online) med det chromatografiske system. Det hele foregår i en flertrins, fuldt automatiseret operation [2]. Princippet er illustreret i figur 3. De molekyler, der bindes af antistoffet immobiliseret på antistofsøjlen, elueres fra antistofsøjlen med lavt pH. Til sidst elueres materialet med en kort organisk gradient af acetonitril/myresyre fra omvendt fase-matricen direkte ind i massespektrometeret.
Ved blot at skifte antistof på immunaffinitetssøjlen kan man bruge systemet til selv i meget komplicerede matricer at analysere stort set enhver analyt, mod hvilken der findes anvendelige antistoffer. Man benytter typisk polyklonale antistoffer, idet varianter i et givent protein eller peptid herved kan analyseres, uden at risikere at én af varianterne mangler netop det antistofbindende område (epitop), som f.eks. et monoklonalt antistof kan være afhængigt af.

Hurtig og nem identifikation af transthyretinvarianter i blodprøver
Transthyretin (TTR) er et lille plasmaprotein med en molekylvægt på 13761,4, der bl.a. er ansvarlig for transport af thyroxin og A vitamin. Hos nogle familier ses varianter (punktmutationer i aminosyresekvenen) i dette protein, der fører til alvorlige og dødelige lidelser. Der kendes over 70 forskellige punktmutationer [3]. Normalt diagnosticeres transthyretinmutationer vha. en polymerase chain reaction (PCR), som dog kræver separate primers for hver mutation eller sekventering af PCR-produktet. Ved brug af det beskrevne todimensionelle massespektrometri system kan proteinet og alle varianter, der giver forskelle i molekylmasse, analyseres direkte fra serum som illustreret i figur 4 [2]. Først isoleres transthyretin fra serum vha. immunaffinitetssøjlen, hvorpå der er bundet kanin-antistoffer rettet mod transthyretin. Immunaffinitetssøjlen elures henover reversed phase-søjlen som afsalter proteinet før elueringen ind i massespektrometret. Da antistoffet på immunaffinitetssøjlen er polyklonalt, binder det flere epitoper og flere forskellige isoformer af transthyretin, også varianter.
I figur 4 ses transthyretin analyseret direkte fra serum fra en patient og en normal person. Der analyseres 10 ml prøve indeholdende 2,5 ml serum. Som det ses i figur 4, kan mutationen (methionin i stedet for leucin i position 111) pga. masseforskellen på +18 let adskilles fra det normale molekyle. Det ses også, at patienten med variant transthyretin er heterozygot, da både normal (masse = 13761,5) og variant (masse = 13778,2) transthyretin er til stede i spektret i et 1:1 forhold. Et specifikt problem for analysen var, at transthyretin indeholder en fri cysteinyl som ved oxidation giver anledning til sulfoxider med +16 (O2) i molekylvægt. Disse former giver anledning til en masseheterogeneitet ved den beskrevne analyse, som er vanskelig at differentiere fra mutationen med +18 i massetilvækst. Problemet blev løst ved at reducere serumprøverne inden analyse ved behandling med dithiothreitol.

Identifikation af amyloid b-peptider
Hos patienter med Alzheimers sygdom fælder et specifikt peptid, amyloid b-peptid (AbP) (figur 1), ud i hjernen som uopløselige øjensynligt destruktive ansamlinger (plaques) (figur 5). Det er omdiskuteret, om disse plaques er en følge af eller en årsag til de neurodegenerative forandringer, der ses ved Alzheimers sygdom. Sygdommen kan ikke kureres, men der er nu udviklet medicin med nogen symptomatisk og sygdomsforhalende virkning, så det er vigtigt at kunne skelne disse patienter fra de ca. 100 andre mulige demenstyper. Det er desværre normalt ikke muligt at diagnosticere Alzheimers sygdom før relativt sent i sygdomsforløbet, og der findes endnu ingen specifikke diagnostiske tests baseret på blod- eller cerebrospinalvæskeprøver.
Vi har derfor arbejdet med at udvikle immunaffinitets-MS-metoder, der kan benyttes til at påvise og karakterisere de AbP-varianter, der måtte frigives fra det syge hjernevæv til blod eller cerebrospinalvæske. AbP eksisterer i flere varianter (figur 1), og man ved at nogle få af disse varianter, der typisk er forlænget med 2-3 aminosyrer C-terminalt, er patologiske og tilstrækkeligt uopløselige til at de danner de omtalte hjerne-plaques. Da hjernen er badet i cerebrospinalvæske, reflekterer væskens indhold af peptider og proteiner til en vis grad hjernevævets tilstand. Ab-peptid varianternes nedsatte tilstedeværelse i cerebrospinalvæsken (formentlig som følge af udfældning i plaques) kan da også støtte diagnosen, men ikke specifikt nok til at niveauerne af de 42 og 43 aminosyrer lange Ab-peptider kan bruges til sikkert at adskille Alzheimer-patienter fra andre former for demens.
Det er kun et begrænset antal af de kendte AbP-varianter, der er undersøgt, idet de traditionelle metoder såsom ELISA kræver variantspecifikke monoklonale antistoffer. Med det beskrevne immunaffinitets-MS-system er det i princippet muligt at isolere hele poolen af Ab-peptidvarianter fra serum eller cerebrospinalvæske med bredt reagerende antistoffer. Efterfølgende karakteriseres alle peptidvarianterne samtidig med massespektrometri. En sådan immunaffinitets-MS måling af Ab-peptider er vist i figur 5, hvor cerebrospinalvæske fra to ikke-demente neurologiske patienter, dvs. patienter, hvor Alzheimers sygdom ikke mistænkes, er undersøgt for massevarianter af AbP. Isoleret på denne måde ses i figur 5A og 5B massespektra fra AbP med en længde på 40 aminosyrer. Arbejdet fortsætter nu med analyse af prøver fra demenspatienter. Det er dog stadig en udfordring at gøre systemet sensitivt nok til at kunne analysere de øvrige varianter, der findes i meget lave koncentrationer (pM-nM) i både cerebrospinalvæske og serum.

Konklusioner
Udnyttelse af antistoffers selektivitet i kombination med den moderne massespektrometris høje opløsningsevne og præcision gør det muligt at forenkle, forbedre og forfine vævsvæske-baserede diagnostiske metoder. De to (eller tre) dimensioner udgøres af immunreagenser (antistoffer) til selektion, reversed phase chromatografi til afsaltning og massespektrometri til detektion. Molekylære varianter af et specifikt protein eller peptid (også i meget lave koncentrationer), i komplicerede biologiske prøvematricer med hundredvis af andre proteiner og peptider, kan på denne måde karakteriseres i et modulært system, hvor antistofferne let kan udskiftes. Systemet har ud over de diagnostiske formål også store muligheder for at give informationer af mere basal betydning for forståelse af normale og patologiske biologiske mekanismer.

Taksigelser
Det her beskrevne arbejde har modtaget økonomisk støtte fra M.L. Jørgensen og Gunnar Hansens Fond, Apotekerfonden af 1991, Lundbeckfonden og Fonden til Lægevidenskabens Fremme. JWS har modtaget støtte fra Forskerakademiet. Samarbejdet med Peter Roepstorff, Syddansk Universitet, Odense, Gunhild Waldemar, Rigshospitalet og Mogens Holst Nissen, Panuminstituttet er højt skattet og har været uvurderligt for projekternes gennemførelse.

Referencer
1. Wild D (Ed.) The Immunoassay Handbook. 2 ed. London: Nature Publishing Group, 2001.
2. Sen JW, Bergen HR, III, Heegaard NHH. On-line immunoaffinity-liquid chromatography-mass spectrometry for identification of amyloid disease markers in biological fluids. Anal Chem 2003; 75(5):1196-1202.
3. Connors LH, Richardson AM, Théberge R, Costello CE. Tabulation of transthyretin (TTR) variants as of 1/1/2000. Amyloid:Int J Exp Clin Invest 2000; 7:54-69.

Figur 1. Forskellige antigener med den samme samme antistofbindende epitop. Her illustreret skematisk ved fem peptider (amyloid b-peptidvarianter) af varierende længde N- eller C-terminalt eller med N-terminal modifikation. Alle varianter bibeholder en epitop, der genkendes af antistoffet (grønt Y). Poolen af peptider kan isoleres ved brug af antistoffet, hvorefter de enkelte varianter, der adskiller sig mht. masse (tabel) vha. massespektrometri (teoretisk spektrum vist) detekteres og karakteriseres semikvantitativt.
Figur 2. Foto af en IA-LC-MS-opsætning. Prøven injiceres vha. en autosampler ind i systemet. Her møder den først en pre-clear-søjle, dernæst en antistofsøjle og til slut en afsaltningssøjle. To HPLC-anlæg sørger for væskestrømmene af de forskellige buffere og organiske solventer. En principskitse er vist i figur 3.
Figur 3. Princippet i det todimensionelle IA-LC-MS-system (som ses i praksis i figur 2) er baseret på tre trin:
A: Injektion af prøve, f.eks. serum over en immunaffinitetskolonne der isolerer analytten,
B: Eluering af immunaffinitetskolonnen over en reversed fasekolonne for afsaltning,
C: Afsaltning på en reversed fasekolonne med efterfølgende eluering ind i massespektrometeret med en kort organisk gradient (3 min).
Figur 4. Massespektre af transthyretin (TTR) efter analyse direkte fra serum vha. immunaffinitets-massespektrometri (kanin-antitransthyretinantistof fra DAKO A/S). Begge prøver er fortyndet 4 x i phosphat-bufret saltvand, pH 7.4 indeholdende 10 mM dithiothreitol.
A og B: 10 ml prøve fra patient heterozygot for en tranthyretinmutation. A, rådata (intensitet som funktion af masse/ladnings (m/z)-værdier). B, afledte masser fra forsøget i A.
C og D: 10 ml serumprøve fra normalt individ forbehandlet på samme måde som beskrevet for patientprøven. C, rådata. D: afledte masser fra forsøget i C.
Figur 5. Massespektre af AbP(1-40) analyseret fra cerebrospinalvæske fra ikke-demente individer. Antistoffer var monoklonale antistoffer (Hyb 310 serie fra Statens Serum Institut (AntibodyShop A/S)). Hhv. 600 ml og 900 ml cerebrospinalvæske blev injiceret i A og B. Der ses 4H+- og 5H+-toppe fra endogen AbP i begge prøver (figur modificeret fra [2]).
Indsat er et billede af et mikroskopipræparat af et sølvfarvet hjernesnit, der viser et plaque omgivet af et antal (sorte) døde nerveceller (Selkoe DJ, Nature 1999, suppl., A23-A31).

Skrevet i: Bioteknologi, Klima og miljø

Seneste nyt fra redaktionen

Chemical ionization mass spectrometry in atmospheric studies

Analytisk kemiArtikler fra Dansk KemiTop19. 05. 2025

Advances in chemical ionization mass spectrometry can improve our understanding of atmospheric composition. Artiklen har været bragt i Dansk Kemi nr. 2, 2025 og kan læses uden illustrationer, strukturer eller ligninger herunder(læs originalartiklen her) Af Varun Kumar, Institut for

Gamle processer, nye muligheder: Nyt kemisk-biologisk koncept til CO2-fangst og omdannelse

AktueltArtikler fra Dansk KemiBioteknologi14. 05. 2025

Oldgamle CO2-ædende mikroorganismer kan fange CO2 direkte fra skorstensrøg og omdanne kulstoffet til grønne molekyler. Artiklen har været bragt i Dansk Kemi nr. 2, 2025 og kan læses uden illustrationer, strukturer eller ligninger herunder(læs originalartiklen her) Af Mads Ujarak Sieborg1 og

Centrotherm clean solutions bliver til Pfeiffer Vacuum+Fab Solutions

AktueltBranchenyt14. 05. 2025

Busch Group annoncerer, at deres brand centrotherm clean solutions bliver en del af Pfeiffer Vacuum+Fab Solutions. Fra september 2025 vil gasreduktionssystemerne til Semicon-industrien, som tidligere blev tilbudt under dette mærke, blive integreret i Pfeiffer-porteføljen og fremover være

I dag får professor Per Halkjær Nielsen Videnskabernes Selskabs Guldmedalje

Branchenyt14. 05. 2025

For blot fjerde gang i dette årtusinde uddeles Videnskabernes Selskabs Guldmedalje. Det sker i dag, hvor bakterieforsker Per Halkjær Nielsen, professor ved Institut for Kemi og Biovidenskab ved Aalborg Universitet, får den fine hæder for sit livsværk og sin holdånd. Han er manden, der kortlægger

Atmosfærisk transport af PFAS til Højarktis

AktueltArtikler fra Dansk KemiKlima og miljø28. 04. 2025

Tilstedeværelsen af PFAS-forbindelser skyldes ikke kun lokale kilder, men de kan langtransporteres i luften til selv meget fjerntliggende arktiske egne. Artiklen har været bragt i Dansk Kemi nr. 2, 2025 og kan læses uden illustrationer, strukturer eller ligninger herunder(læs originalartiklen

Biotek-firma bag fedme-medicin på tabletform har lagt en klar plan om samarbejde eller opkøb

AktueltMedicinalkemi21. 04. 2025

I dag er det frem med nålen, hvis man er i behandling med diverse former for fedme-medicin. Det hæmmer imidlertid udbredelsen på specielt asiatiske og afrikanske markeder, hvor der er en udtalt nålefobi. Derfor arbejder det danskstiftede biotekselskab Pila Pharma med at få udvikle deres

Dansk virksomhed vil vende produktionen af ammoniak på hovedet – ned i en lille container

AktueltBioteknologiFødevarekemi07. 04. 2025

NitroVolt, en dansk biotech-virksomhed, vil vende produktionen af ammoniak på hovedet. I stedet for den velkendte løsning, der bygger på den energitunge Haber-Bosch-proces, vil produktionen nu foregå i en container, der fx kan stå direkte ude hos en landmand. Ammoniak til kunstgødning er en slags

En EU-historie om nomenklatur – og ginseng til hunde, katte og heste!

AktueltArtikler fra Dansk KemiHistorisk kemi01. 04. 2025

Artiklen har været bragt i Dansk Kemi nr. 6, 2024 og kan læses uden illustrationer, strukturer og ligninger herunder. Læs originalartiklen her Nomenklaturudvalget får indimellem henvendelser om dansk kemisk nomenklatur fra de oversættere i EU, hvis opgave det er at oversætte EU-lovgivning på

Tysk elektrolyseanlæg er som det første i verden blevet integreret direkte i kemisk produktion

AktueltEnergi31. 03. 2025

Efter en byggeperiode på omkring to år, er BASF nye 54 megawatt elektrolyseanlæg blevet indviet. Udover at være Tyskland største, med en kapacitet til at producere op til 8.000 ton grøn brint årligt, skriver det også historie på et andet område. Brinten skal primært anvendes som råmateriale i

Dansk innovation blander sig i toppen over lande med de fleste patentansøgninger

AktueltBranchenyt31. 03. 2025

Danske virksomheder er fortsat nogle af de mest aktive i Europa til at innovere. Det viser nye tal fra Den Europæiske Patentmyndighed, EPO, som udsteder patenter, der kan dække i op til 45 lande. Vestas, Novozymes og Danmarks Tekniske Universitet har leveret de største bidrag til, at Danmark kan

Tilmeld Nyhedsbrev

Tilmeld dig til dit online branchemagasin/avis





Få fuld adgang til indlægning af egne pressemeddelelser...
Læs mere her

/Nyheder

  • DENIOS ApS

    Sådan transporterer du lithiumbatterier sikkert

  • Kem-En-Tec Nordic

    Opnå rent DNA/RNA på få minutter og på bæredygtig vis!

  • Kem-En-Tec Nordic

    Sikker gelfarvning på kun 15 minutter?

  • DENIOS ApS

    Her er den oversete vej til et sundere arbejdsmiljø

  • Busch Vakuumteknik A/S

    Pfeiffer Vacuum+Fab Solutions lancerer den nye HiCube Neo RGA

  • Busch Vakuumteknik A/S

    centrotherm clean solutions bliver til Pfeiffer Vacuum+Fab Solutions

  • DENIOS ApS

    Ved du, hvornår det er tid til at vedligeholde, udskifte eller flytte dit opsamlingskar?

  • DENIOS ApS

    3 sikkerhedsfunktioner, du skal kigge efter på dit opsamlingskar

  • Holm & Halby

    VidensDage 2025: To dage i videnskabens og fremtidens tegn

  • Holm & Halby

    Holm & Halby deltager i Europe Biobank Week 2025

Vis alle nyheder fra vores FOKUSpartnere ›

Seneste Nyheder

  • Chemical ionization mass spectrometry in atmospheric studies

    19.05.2025

  • Gamle processer, nye muligheder: Nyt kemisk-biologisk koncept til CO2-fangst og omdannelse

    14.05.2025

  • Centrotherm clean solutions bliver til Pfeiffer Vacuum+Fab Solutions

    14.05.2025

  • I dag får professor Per Halkjær Nielsen Videnskabernes Selskabs Guldmedalje

    14.05.2025

  • Atmosfærisk transport af PFAS til Højarktis

    28.04.2025

  • Biotek-firma bag fedme-medicin på tabletform har lagt en klar plan om samarbejde eller opkøb

    21.04.2025

  • Dansk virksomhed vil vende produktionen af ammoniak på hovedet – ned i en lille container

    07.04.2025

  • En EU-historie om nomenklatur – og ginseng til hunde, katte og heste!

    01.04.2025

  • Tysk elektrolyseanlæg er som det første i verden blevet integreret direkte i kemisk produktion

    31.03.2025

  • Dansk innovation blander sig i toppen over lande med de fleste patentansøgninger

    31.03.2025

  • Ny grundbog tager studerende på videregående uddannelser ind i den basale kemi

    26.03.2025

  • Nedrivningsarbejdere i kontakt med PCB slipper med skrækken – kun lave niveauer i blodet

    25.03.2025

  • Styrkelse af nyfundet gen kan gøre kartoflen resistent over for svampeangreb

    24.03.2025

  • Fra forskning i nanosikkerhed til mere sikker håndtering af nanomaterialer i det danske arbejdsmiljø

    21.03.2025

  • Dansk forbud mod PFAS er lige på trapperne – indsigelsesfrist mod 2024-aftale er overskredet

    20.03.2025

Alle nyheder ›

Læs Dansk Kemi online

Annoncering i Dansk Kemi

KONTAKT

TechMedia A/S
Naverland 35
DK - 2600 Glostrup
www.techmedia.dk
Telefon: +45 43 24 26 28
E-mail: info@techmedia.dk
Privatlivspolitik
Cookiepolitik